Hlavní navigace

Chcete pomoci v boji s koronavirem? Přes Folding@home můžete svým GPU hledat léky

17. 3. 2020

Sdílet

Pokud je vám líto, že přestal fungovat projekt distribuovaných výpočtů SETI@home, hledající signály z vesmíru, máte teď jako náplast možnost zapojit svůj nevyužitý výpočetní výkon do jiné činnosti. Na základě aktuálních potřeb v době pandemie nákazy koronavirem (COVID-19) totiž vznikly distribuované výpočetní projekty zaměřené na hledání léků proti této nemoci. Pokud tedy chcete aspoň vzdáleně přispět k této větvi snah o zvládnutí této události, můžete pomoci zapřažením svého počítače.  

Projekty hledající potenciální léky proti COVID-2019 ve Folding@home

Tyto distribuované výpočty nebudou mít formu úplně nového programu, zastřešuje je totiž projekt folding@home, který už mnozí z vás budou znát či přímo provozovat. Jde o distribuované výpočty, kdy si domácí počítače rozdělují práci na simulaci chování složitých molekul, kteréžto poznání pomáhá s vývojem léčby různých lidských nemocí, od rakoviny po Parkinsonovu nebo Alzheimerovu chorobu (takže pomůžete dobré věci, i pokud zůstanete zapojení po skončení současné pandemie).

Do Foldingu@home bylo nyní zařazeno několik výzkumných projektů, které se viru COVID-19 týkají: analyzují jeho strukturu a interakci s lidskými buňkami a hledají látky, které by proti viru mohly být účinné. Není samozřejmě zaručeno, že z těchto analýz vzejde rychle účinný lék, který v dohledné době šíření zastaví. Ale tyto analýzy přispívají k prozkoumání co nejvíce cest, jak proti němu bojovat a mohou pomoci dalšímu výzkumu. Folding@home přímo spolupracuje s mnoha výzkumníky a laboratořemi, takže by výpočetní pomoc měla průběžně pomáhat v jejich snahách.

K hledání potenciálních léčiv proti koronaviru mají přispět následující projekty. Měly by být zahrnuty mezi aktivní projekty i tehdy, pokud klienta nakonfigurujute pro příjem jakékoliv práce (nastavením zapojení na „Any Disease“).

  • 11741: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2. atoms: 165550, credit: 15396
  • 11746: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2 (alternative structure to 11741). atoms: 182699, credit: 16615
  • 11742: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease in complex with an inhibitor. atoms: 62227, credit: 9405
  • 11743: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease – potential drug target. atoms: 62180, credit: 9405
  • 11744: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 109578, credit: 7608
  • 11745: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain mutated to the SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 110370, credit: 7685

Zapojení do projektu je možné s procesorem Intel, AMD a dokonce i ARM a GPU GeForce i Radeon. Práce, kterou tyto projekty vašemu počítači zadávají, je nicméně určená zejména pro grafické karty (jde o kód Core22 v OpenCL), takže nejvhodnější je právě zapojit paže herních GPU. Klient, tedy aplikace, kterou musíte nainstalovat, existuje pro Windows, Linux i MacOS, začít můžete zde.

Pokud se k těmto projektům připojíte, buďte trpěliví. Údajně teď může chvíli trvat, než vašemu klientu (počítači) bude přidělen kus práce. Jednak je asi mezi lidmi vyšší zájem o tyto projekty, prý ale také do výpočtů jeden velký cloudový provozovat zapojil své servery s instancemi vybavenými GPU, které zřejmě hodně pracovních přídělů pohltily.

https://twitter.com/NVIDIAGeForce/status/1238496311776653312

Hráče vybídla k poskytnutí nečinných GPU (v době, kdy si chcete zkrátit karanténu hraním, je po vás samozřejmě nikdo nechce) mimochodem také Nvidia.

Zdroje: Folding@home (1, 2)

Weby ke koronaviru Covid-19 (fotogalerie)

Byl pro vás článek přínosný?